261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1014 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0436  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  73.15 
 
 
446 aa  694    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1014  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  933    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  56.63 
 
 
445 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  56.5 
 
 
447 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  56.73 
 
 
446 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.3 
 
 
447 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  55.16 
 
 
445 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.59 
 
 
447 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0787  hypothetical protein  53.36 
 
 
447 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.41 
 
 
446 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1147  hypothetical protein  52.24 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  54.24 
 
 
446 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2025  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.12 
 
 
449 aa  481  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000691604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1932  hypothetical protein  52.26 
 
 
447 aa  475  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.81 
 
 
448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0382  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.33 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1350  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.64 
 
 
447 aa  425  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.335116  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0577  4-hydroxybutyrate CoA transferase (cat2-1)  44.16 
 
 
444 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537722  hitchhiker  0.000215809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.4 
 
 
428 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.43 
 
 
437 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.74 
 
 
437 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.67 
 
 
437 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.98 
 
 
437 aa  289  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.2 
 
 
437 aa  289  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  37.44 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.67 
 
 
424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.67 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.76 
 
 
453 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.44 
 
 
424 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.06 
 
 
479 aa  275  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.53 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.79 
 
 
424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.84 
 
 
455 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.04 
 
 
407 aa  272  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.46 
 
 
432 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.42 
 
 
441 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.26 
 
 
616 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.53 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.36 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.81 
 
 
616 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.94 
 
 
645 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.67 
 
 
442 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.78 
 
 
432 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.84 
 
 
431 aa  263  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.51 
 
 
431 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  35.36 
 
 
431 aa  262  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.16 
 
 
437 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.55 
 
 
617 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.68 
 
 
428 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.68 
 
 
420 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.61 
 
 
441 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.45 
 
 
430 aa  256  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.86 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.86 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.86 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.86 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.86 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.86 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.86 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.59 
 
 
444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.89 
 
 
427 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.53 
 
 
431 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.36 
 
 
433 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.19 
 
 
445 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.76 
 
 
432 aa  249  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.02 
 
 
449 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  34.31 
 
 
432 aa  249  7e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.53 
 
 
428 aa  249  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.47 
 
 
428 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.81 
 
 
430 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.66 
 
 
431 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.02 
 
 
449 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.57 
 
 
428 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.37 
 
 
614 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.72 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.26 
 
 
428 aa  245  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.27 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.27 
 
 
440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.57 
 
 
428 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.57 
 
 
428 aa  243  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.79 
 
 
430 aa  243  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.57 
 
 
428 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.57 
 
 
428 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.04 
 
 
440 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.86 
 
 
428 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.24 
 
 
428 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.34 
 
 
428 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  36.86 
 
 
615 aa  240  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.4 
 
 
428 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37 
 
 
432 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34 
 
 
443 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.77 
 
 
441 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.77 
 
 
441 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.77 
 
 
441 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  34.32 
 
 
431 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.77 
 
 
441 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.65 
 
 
429 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2128  hypothetical protein  35.54 
 
 
448 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.535079  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  34.23 
 
 
438 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  32.26 
 
 
634 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>