More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1001 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 		 773 aa  1608    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  31.07 
 
 		 967 aa  282  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  37.25 
 
 		 848 aa  220  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  36.54 
 
 		 1287 aa  213  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  32.12 
 
 		 993 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  37.87 
 
 		 1077 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  36.98 
 
 		 938 aa  207  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  34.57 
 
 		 905 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  36.02 
 
 		 1348 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  36.19 
 
 		 1418 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  36.52 
 
 		 928 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  36.52 
 
 		 956 aa  197  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  37.4 
 
 		 1051 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  36.18 
 
 		 946 aa  192  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  34.66 
 
 		 953 aa  190  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  34.66 
 
 		 953 aa  190  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  34.19 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  34.51 
 
 		 813 aa  187  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  34.02 
 
 		 1053 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  33.08 
 
 		 1033 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  34.63 
 
 		 967 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  36.49 
 
 		 1028 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.61 
 
 		 979 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  32.88 
 
 		 1052 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  33.53 
 
 		 815 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  32.69 
 
 		 1063 aa  181  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  33.42 
 
 		 1043 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.06 
 
 		 1031 aa  178  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  34.71 
 
 		 1055 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  33.99 
 
 		 987 aa  178  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  34.76 
 
 		 1149 aa  178  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  32.76 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  35.99 
 
 		 524 aa  175  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  33.78 
 
 		 1017 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  33.43 
 
 		 952 aa  174  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  33.52 
 
 		 1061 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  33.88 
 
 		 982 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  34.16 
 
 		 1055 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  34.16 
 
 		 1055 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  32.95 
 
 		 979 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  33.9 
 
 		 1029 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.25 
 
 		 974 aa  168  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  30.75 
 
 		 581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  32.35 
 
 		 1062 aa  165  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  31.42 
 
 		 1035 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  33.98 
 
 		 1051 aa  161  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  30.67 
 
 		 607 aa  161  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.27 
 
 		 606 aa  160  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  31.36 
 
 		 1066 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  31.25 
 
 		 475 aa  159  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  33.79 
 
 		 1041 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.88 
 
 		 949 aa  157  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  33.43 
 
 		 1033 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  30.33 
 
 		 1065 aa  156  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  33.14 
 
 		 1033 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  28.77 
 
 		 629 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  33.24 
 
 		 1042 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  30.06 
 
 		 459 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  32.08 
 
 		 1058 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  30.84 
 
 		 469 aa  152  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  31.02 
 
 		 706 aa  150  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  28.69 
 
 		 643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  29.48 
 
 		 462 aa  147  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  28.42 
 
 		 949 aa  144  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 		 980 aa  141  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0909  type III restriction protein res subunit  31.84 
 
 		 1042 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.37 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5882  helicase domain protein  30.57 
 
 		 1169 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.37 
 
 		 560 aa  137  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  27.72 
 
 		 538 aa  135  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.66 
 
 		 504 aa  126  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  26.26 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.71 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  26.26 
 
 		 560 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 		 560 aa  124  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  29.54 
 
 		 558 aa  124  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  29.77 
 
 		 569 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.26 
 
 		 398 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.3 
 
 		 485 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 545 aa  122  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.3 
 
 		 485 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.95 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  27.45 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  27.55 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.91 
 
 		 385 aa  118  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  28.04 
 
 		 463 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  28.27 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  30.11 
 
 		 479 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  26.35 
 
 		 503 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  26.82 
 
 		 574 aa  114  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  26.35 
 
 		 512 aa  114  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.63 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 		 479 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  29.3 
 
 		 479 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  25.57 
 
 		 760 aa  111  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  26.11 
 
 		 760 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  25.91 
 
 		 583 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>