More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0974 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  43.19 
 
 
853 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 
853 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 
851 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 
858 aa  729    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  48.51 
 
 
871 aa  788    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
857 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
856 aa  679    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 
859 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 
873 aa  709    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  44.83 
 
 
854 aa  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
854 aa  685    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 
881 aa  701    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
892 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 
872 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 
858 aa  642    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 
862 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
856 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  44.29 
 
 
855 aa  700    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 
892 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 
890 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 
894 aa  709    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
928 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
846 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 
846 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 
859 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 
853 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  41.34 
 
 
855 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.11 
 
 
895 aa  731    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 
903 aa  658    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  45.44 
 
 
900 aa  748    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
850 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 
856 aa  675    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
854 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
938 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  44.16 
 
 
863 aa  683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 
860 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 
881 aa  719    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  45.8 
 
 
870 aa  751    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 
883 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 
856 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 
873 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 
856 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  49.49 
 
 
872 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 
904 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
856 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 
892 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 
939 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 
882 aa  658    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  50.24 
 
 
932 aa  835    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 
905 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.07 
 
 
863 aa  769    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.82 
 
 
854 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 
882 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 
868 aa  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  43.39 
 
 
892 aa  688    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  45.45 
 
 
858 aa  722    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  44.5 
 
 
872 aa  721    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  46.97 
 
 
872 aa  761    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
887 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  48.92 
 
 
870 aa  843    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
884 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
884 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 
853 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 
857 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 
862 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  44.78 
 
 
887 aa  766    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 
872 aa  699    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 
859 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
851 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 
882 aa  643    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
855 aa  642    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  45.29 
 
 
882 aa  734    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  44.5 
 
 
872 aa  721    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 
860 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
874 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 
889 aa  667    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 
855 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 
856 aa  663    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  49.63 
 
 
910 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  49.63 
 
 
910 aa  787    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 
856 aa  664    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 
901 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 
861 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 
861 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.66 
 
 
878 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  43.21 
 
 
861 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
859 aa  1746    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 
859 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 
871 aa  681    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 
855 aa  703    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
840 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 
857 aa  677    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 
853 aa  674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 
852 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 
855 aa  703    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  45.74 
 
 
857 aa  748    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45.84 
 
 
889 aa  736    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 
868 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 
861 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  47.39 
 
 
870 aa  768    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>