217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0956 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  46.25 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  45.68 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  46.25 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  44.16 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  38.27 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  37.35 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  41.25 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  36.47 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  40.7 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  34.52 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  32.56 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  37.65 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  37.65 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  36.47 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  37.93 
 
 		 197 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  37.93 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  33.72 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  34.21 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  35.63 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  33.73 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  38.81 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  38.81 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  30.59 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  31.18 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  31.46 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  38.81 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  38.81 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  38.81 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  38.81 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  38.81 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  32.1 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  38.81 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 		 182 aa  57  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  30.86 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.56 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32.56 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  36.51 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  29.27 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  37.33 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  36.78 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  38.75 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  37.14 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  28.24 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  28.24 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  30.38 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  35.82 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3452  hypothetical protein  32.53 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  34.33 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0607  protein of unknown function YGGT  35.82 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  29.07 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  34.67 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  35.96 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  31.88 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  35.94 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  39.06 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02073  hypothetical protein  38.71 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>