More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0936 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  100 
 
 		 113 aa  233  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 106 aa  90.5  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  57.89 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  57.89 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  39.58 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  42.86 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  38.95 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  42.42 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  50 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  40.23 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  32.32 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  35.83 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  45.31 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  44.78 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40.3 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.19 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.24 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  41.54 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.24 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 328 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 349 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 354 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  37.35 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>