More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0908 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  49.74 
 
 		 238 aa  224  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  45.98 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  49.75 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  48.22 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000715916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  39.32 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 281 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  40 
 
 		 327 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  41.75 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  37.45 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  40.31 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  38.38 
 
 		 299 aa  175  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1443  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  36.36 
 
 		 299 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.2968800000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  35.86 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.06 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 		 337 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  33.76 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.67 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 254 aa  141  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  31.88 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.44 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.82 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  31.44 
 
 		 254 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31 
 
 		 254 aa  138  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000107726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  31.44 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.77 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.35 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  33.19 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0152  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.91 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  32.31 
 
 		 261 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  31.79 
 
 		 259 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  29.27 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 382 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.02 
 
 		 279 aa  118  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  31.46 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 404 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 387 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 368 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  31.02 
 
 		 373 aa  111  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  30.05 
 
 		 417 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  31.16 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  30.66 
 
 		 468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4011  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 360 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 372 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.09 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 465 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  30.95 
 
 		 488 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  27.55 
 
 		 705 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  30.41 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 		 305 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  27.78 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  28.03 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>