117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0876 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 208 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.24 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.83 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.67 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.92 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.63 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.97 
 
 		 211 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.63 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  44.39 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.95 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.44 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.61 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.28 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.44 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.62 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.57 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.6 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.98 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  40 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.92 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.57 
 
 		 206 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.32 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.66 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.3 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.3 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.99 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.16 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.86 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  34.2 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.65 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.73 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  29 
 
 		 1010 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.72 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.21 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.91 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.87 
 
 		 369 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.57 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.02 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.02 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.77 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.31 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.91 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.93 
 
 		 372 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.22 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.59 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.61 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.61 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.68 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.59 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  29.29 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.96 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.79 
 
 		 357 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  28.46 
 
 		 381 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  27.47 
 
 		 406 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.24 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.7 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.77 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  25.31 
 
 		 401 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  27.01 
 
 		 401 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.08 
 
 		 422 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.59 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  27.12 
 
 		 417 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.17 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  31.19 
 
 		 378 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  31.58 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  28.57 
 
 		 572 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 		 375 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 		 398 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.03 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  27.74 
 
 		 402 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.15 
 
 		 331 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.64 
 
 		 331 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.67 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.87 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  29.38 
 
 		 346 aa  48.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.37 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.12 
 
 		 370 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 331 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.1 
 
 		 331 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  27.01 
 
 		 393 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2156  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.06 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220055  normal  0.484045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.34 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  31.52 
 
 		 375 aa  44.7  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  22.89 
 
 		 338 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  27.66 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.54 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.4 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.48 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.15 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.56 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  26.39 
 
 		 546 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  26.39 
 
 		 546 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  26.39 
 
 		 546 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>