More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0874 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
677 aa  1358    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 
675 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 
691 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 
666 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  47.11 
 
 
692 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 
713 aa  586  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
660 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 
666 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 
673 aa  560  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
697 aa  555  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
674 aa  545  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
655 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
681 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
671 aa  531  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
679 aa  532  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
671 aa  528  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
673 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  44.04 
 
 
685 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  41.65 
 
 
701 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
696 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
695 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
656 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  37.9 
 
 
667 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
653 aa  465  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
729 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  37.05 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  37.63 
 
 
667 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  37.05 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  37.05 
 
 
672 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  36.61 
 
 
670 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  36.3 
 
 
670 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  37.76 
 
 
660 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
649 aa  435  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
664 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
658 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
675 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
670 aa  424  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  37.12 
 
 
702 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  35.16 
 
 
801 aa  413  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
671 aa  402  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
657 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
719 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  47.69 
 
 
803 aa  389  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
957 aa  385  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 
954 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
724 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
770 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
919 aa  385  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  50.13 
 
 
1089 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  50.52 
 
 
610 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  34.64 
 
 
702 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 
745 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.97 
 
 
770 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  47.84 
 
 
770 aa  382  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
687 aa  377  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  47.56 
 
 
783 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  50.26 
 
 
598 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  47.81 
 
 
785 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  49.37 
 
 
1031 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
919 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
677 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
920 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  48.49 
 
 
774 aa  379  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
607 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
671 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
728 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  47.16 
 
 
769 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  47.16 
 
 
769 aa  372  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
686 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 
603 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 
604 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
686 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  46.56 
 
 
601 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
695 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  47.16 
 
 
769 aa  372  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
685 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
685 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  50.52 
 
 
1030 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 
606 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 
558 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
688 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 
720 aa  364  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
690 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  33.01 
 
 
715 aa  364  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.7 
 
 
704 aa  363  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.72 
 
 
669 aa  361  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
709 aa  361  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  47.38 
 
 
751 aa  360  6e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  47.14 
 
 
897 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
691 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.14 
 
 
681 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
733 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  33.24 
 
 
662 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
698 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  46.35 
 
 
767 aa  357  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  32.55 
 
 
733 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 
759 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  45.38 
 
 
714 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 
746 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 
741 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>