28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0872 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  25.79 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  26.44 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  23.98 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  26.64 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  25.26 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  27.45 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  23.47 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  20.39 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  24.88 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  22.54 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  25.93 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  22.86 
 
 
314 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  23.33 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  24.66 
 
 
229 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  24.66 
 
 
229 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  22.42 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  21.26 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  22.84 
 
 
230 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  22.6 
 
 
317 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  22.12 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  21.54 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2373  type IV pilus assembly PilZ  24.8 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  32.52 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1051  type IV pilus assembly PilZ  29.31 
 
 
119 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1962  type IV pilus assembly PilZ  27.84 
 
 
145 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  0.739612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  25.37 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0636  type IV pilus assembly PilZ  27.21 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>