More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0867 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
253 aa  492  1e-138  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 
259 aa  181  9e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  38.17 
 
 
265 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  38.82 
 
 
257 aa  163  2e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  38.33 
 
 
261 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  37.66 
 
 
261 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  35.32 
 
 
255 aa  147  2e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.89137e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  34.17 
 
 
261 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  35.71 
 
 
260 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  34.63 
 
 
261 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  36.48 
 
 
260 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  34.13 
 
 
264 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  35.46 
 
 
264 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 
260 aa  136  3e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  35.59 
 
 
255 aa  135  7e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  32 
 
 
255 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  32.95 
 
 
265 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  32.93 
 
 
264 aa  129  5e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  35.29 
 
 
253 aa  127  1e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 
255 aa  127  2e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  35.71 
 
 
257 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  34.68 
 
 
259 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  33.64 
 
 
253 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.77 
 
 
265 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  34.3 
 
 
258 aa  120  2e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  33.82 
 
 
266 aa  120  2e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 
255 aa  118  8e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 
255 aa  117  1e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  31.78 
 
 
260 aa  118  1e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 
255 aa  117  1e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 
253 aa  117  2e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  33.94 
 
 
263 aa  115  8e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  28.28 
 
 
261 aa  115  9e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.72 
 
 
261 aa  114  1e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.2 
 
 
258 aa  114  2e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  31.7 
 
 
265 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  31.65 
 
 
260 aa  112  4e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  31.25 
 
 
265 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  31.7 
 
 
265 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  32 
 
 
265 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  31.25 
 
 
265 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  31.25 
 
 
265 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  29.78 
 
 
256 aa  112  8e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  30.4 
 
 
261 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  29.78 
 
 
256 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  31.91 
 
 
262 aa  110  2e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  30.49 
 
 
265 aa  110  2e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  30.84 
 
 
259 aa  110  2e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  31.43 
 
 
263 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.49 
 
 
264 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  30.23 
 
 
267 aa  109  4e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
256 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  29.88 
 
 
253 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  29.83 
 
 
260 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  32.54 
 
 
257 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
256 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  30.8 
 
 
260 aa  108  7e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.04 
 
 
261 aa  108  8e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  31.3 
 
 
266 aa  108  9e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  30.36 
 
 
260 aa  108  9e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  30.36 
 
 
260 aa  108  9e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  31.33 
 
 
260 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
254 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.96 
 
 
247 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
264 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.10874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  32.44 
 
 
261 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
264 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
264 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
264 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
264 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 
260 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  30.56 
 
 
263 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
265 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
265 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
265 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
265 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  32.34 
 
 
239 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 
264 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  30.41 
 
 
267 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  32.26 
 
 
258 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 
256 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
260 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 
247 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
260 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.41 
 
 
253 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
260 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  30.9 
 
 
253 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 
252 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
257 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  31.25 
 
 
256 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  29.76 
 
 
260 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  28.94 
 
 
257 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 
256 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  29.37 
 
 
260 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  29.2 
 
 
247 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
260 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 
260 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  32.02 
 
 
264 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 
260 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>