35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0845 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0845  transcriptional repressor CodY  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3711  transcriptional repressor CodY  57.03 
 
 		 262 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1031  transcriptional repressor CodY  55.47 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000437393  unclonable  0.0000000093058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07580  transcriptional repressor CodY  55.91 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1228  transcriptional repressor CodY  52.73 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1979  transcriptional repressor CodY  53.7 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000233439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1386  transcriptional repressor CodY  53.67 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062677  normal  0.893187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1955  transcriptional repressor CodY  51.17 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00079706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1673  transcriptional repressor CodY  51.17 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000117412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1697  transcriptional repressor CodY  52.55 
 
 		 250 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00224201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0605  transcriptional repressor CodY  49.8 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1107  transcriptional repressor CodY  52.55 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1999  transcriptional repressor CodY  52.94 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2480  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000457374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3926  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1317  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000604524  hitchhiker  6.27624e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3651  transcriptional repressor CodY  53.1 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3875  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000053796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3840  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.06585e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3869  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3966  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000207979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3587  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000152873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3569  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.9638199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3679  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000500442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0821  transcriptional repressor CodY  46.9 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298732  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1340  transcriptional repressor CodY  47.06 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000548296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1315  transcriptional repressor CodY  47.06 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000018867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2721  transcriptional repressor CodY  46.74 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000105427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2378  transcriptional repressor CodY  41.15 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000594267  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1341  GTP-sensing pleiotropic transcriptional repressor CodY  43.02 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000508255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1675  transcriptional repressor CodY  38.78 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1599  transcriptional repressor CodY  38.22 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00104108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0168  transcriptional repressor CodY  37.21 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000303115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2177  transcriptional repressor CodY  40.45 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.494459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1982  pleiotropic transcriptional repressor  22.91 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>