More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0808 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  59.9 
 
 		 207 aa  252  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  53.4 
 
 		 205 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  53.4 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  53.17 
 
 		 210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  50.25 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  49.49 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  45.71 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  44.98 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.07 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  47.42 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  43.81 
 
 		 251 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  45.5 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  44.06 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  40.1 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  43.22 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  44.08 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  39.61 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 		 212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  39.22 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  39.22 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  38.73 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  38.71 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  40.98 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  41.26 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  40.98 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  40.98 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  40.98 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  41.75 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  37.44 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  41.21 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 225 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.98 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  39.51 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  39.51 
 
 		 209 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  42.64 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  36.54 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  40.61 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.76 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  39.81 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  41.06 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  40.1 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  39.51 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  39.51 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  39.02 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  37.13 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.44 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.27 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  42.21 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>