227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0750 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  7.573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  55.73 
 
 
192 aa  222  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  55.38 
 
 
191 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  49.73 
 
 
192 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  54.3 
 
 
190 aa  201  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  51.61 
 
 
193 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  47.85 
 
 
190 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  44.97 
 
 
207 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  46.28 
 
 
195 aa  179  3e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  48.62 
 
 
195 aa  177  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  46.93 
 
 
197 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  47.59 
 
 
191 aa  173  1e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  46.03 
 
 
190 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  48.07 
 
 
200 aa  166  3e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  45.86 
 
 
193 aa  164  1e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  45.36 
 
 
195 aa  163  2e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  44.02 
 
 
189 aa  156  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  5.57218e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  46.96 
 
 
199 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.36885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  39.46 
 
 
191 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  42.53 
 
 
198 aa  152  3e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  40.54 
 
 
192 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  41.99 
 
 
193 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  38.5 
 
 
193 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.63106e-07  unclonable  1.37407e-10 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  40.88 
 
 
191 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  34.38 
 
 
207 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  36.14 
 
 
218 aa  127  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  40.51 
 
 
187 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  37.57 
 
 
251 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  35.79 
 
 
241 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.58134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  31.25 
 
 
200 aa  120  1e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  34.57 
 
 
244 aa  119  2e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  36.61 
 
 
184 aa  117  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  36.02 
 
 
187 aa  116  2e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  36.9 
 
 
245 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  33.17 
 
 
188 aa  115  4e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  34.02 
 
 
242 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.23866e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  36.69 
 
 
187 aa  113  2e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  37.22 
 
 
181 aa  113  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  34.39 
 
 
187 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  31.72 
 
 
187 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.32173e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  36.96 
 
 
183 aa  110  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.87112e-10  decreased coverage  6.9205e-08 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  37.7 
 
 
184 aa  109  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  39.74 
 
 
201 aa  108  4e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  36.09 
 
 
257 aa  108  4e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.45405e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  32.97 
 
 
197 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 
182 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.69 
 
 
189 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  31.96 
 
 
185 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  31.02 
 
 
257 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.4 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  31.89 
 
 
197 aa  99  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  1.14136e-06 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  36.48 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  34.12 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  28.25 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  30.48 
 
 
253 aa  80.1  2e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.09479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  32.4 
 
 
191 aa  76.3  3e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  29.71 
 
 
207 aa  73.2  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  27.32 
 
 
203 aa  73.2  3e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  27.71 
 
 
188 aa  72.4  4e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  29.05 
 
 
189 aa  72  5e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  32.48 
 
 
153 aa  70.9  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  25.29 
 
 
184 aa  70.5  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  26.77 
 
 
209 aa  69.7  3e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.17 
 
 
186 aa  69.7  3e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  26.44 
 
 
184 aa  68.9  4e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  25.38 
 
 
205 aa  68.6  6e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  30.32 
 
 
188 aa  68.6  6e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  23.87 
 
 
205 aa  68.2  9e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  24 
 
 
184 aa  68.2  9e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  24.68 
 
 
205 aa  68.2  9e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
209 aa  67.4  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  35.56 
 
 
202 aa  67  2e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  27.15 
 
 
186 aa  66.6  2e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  30.05 
 
 
203 aa  66.2  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  32.56 
 
 
186 aa  65.5  5e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  32.09 
 
 
203 aa  65.5  5e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  28.73 
 
 
186 aa  65.5  6e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  27.62 
 
 
233 aa  65.1  6e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  29.03 
 
 
188 aa  64.7  8e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  28.34 
 
 
207 aa  64.7  9e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  30.41 
 
 
203 aa  64.7  9e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  27.67 
 
 
188 aa  64.7  9e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  31.93 
 
 
227 aa  64.3  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  26.92 
 
 
205 aa  64.3  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 
189 aa  63.9  1e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  24.71 
 
 
184 aa  63.9  2e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  25.64 
 
 
204 aa  63.9  2e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  63.2  2e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1085  hypothetical protein  36.07 
 
 
119 aa  62.8  3e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  31.78 
 
 
126 aa  62.8  3e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 
215 aa  62  5e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  32.96 
 
 
206 aa  62  6e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  28.39 
 
 
188 aa  62  6e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  25.53 
 
 
196 aa  62  6e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  61.6  7e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 
186 aa  61.6  8e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  26.8 
 
 
203 aa  61.2  9e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>