57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0748 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  65.85 
 
 
325 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  65.04 
 
 
317 aa  178  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  61.16 
 
 
302 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  62.18 
 
 
304 aa  151  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  63.33 
 
 
304 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2786  hypothetical protein  62.5 
 
 
340 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  62.5 
 
 
300 aa  147  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  61.98 
 
 
292 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  61.48 
 
 
284 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  60.66 
 
 
283 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  58.2 
 
 
290 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  58.54 
 
 
297 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2793  hypothetical protein  58.2 
 
 
301 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  52.14 
 
 
315 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  47.46 
 
 
311 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  44 
 
 
317 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  43.2 
 
 
313 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  37.29 
 
 
330 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  36.44 
 
 
318 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1707  hypothetical protein  45.88 
 
 
280 aa  90.1  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.420351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  32.52 
 
 
311 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  33.61 
 
 
319 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  32.52 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  33.61 
 
 
319 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  30.89 
 
 
307 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  31.15 
 
 
336 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  32.03 
 
 
311 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3365  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  32.79 
 
 
339 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  31.97 
 
 
324 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  34.48 
 
 
316 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  31.01 
 
 
310 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  31.97 
 
 
324 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  32.82 
 
 
293 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  31.25 
 
 
311 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  31.01 
 
 
334 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  30.83 
 
 
316 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  28.68 
 
 
312 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  27.69 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  29.37 
 
 
325 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  34.82 
 
 
335 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  32.2 
 
 
317 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  29.03 
 
 
312 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  29.37 
 
 
325 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  29.31 
 
 
310 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  33.93 
 
 
341 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  30.15 
 
 
320 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  33.64 
 
 
317 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  31.82 
 
 
321 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  31.82 
 
 
324 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  29.73 
 
 
327 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0149  hypothetical protein  22.92 
 
 
298 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  24 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>