279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0683 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  43.75 
 
 
209 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  41.71 
 
 
213 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  41.29 
 
 
213 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  40.21 
 
 
190 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  40.87 
 
 
214 aa  164  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  41.58 
 
 
247 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  40.61 
 
 
235 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  39.25 
 
 
280 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  38.14 
 
 
221 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  36.89 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  34.63 
 
 
226 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.89 
 
 
480 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  35.94 
 
 
468 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  44.1 
 
 
200 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.41 
 
 
480 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.32 
 
 
476 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.5 
 
 
472 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  37.93 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  39.44 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35 
 
 
473 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.81 
 
 
489 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  36.04 
 
 
218 aa  134  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  38.42 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  35.15 
 
 
465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  35.15 
 
 
465 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  34.03 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  37.57 
 
 
306 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  35.64 
 
 
312 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  34.31 
 
 
472 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  34.31 
 
 
472 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.31 
 
 
472 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.84 
 
 
487 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  32.85 
 
 
226 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  35.05 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  32.99 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.98 
 
 
478 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  32.54 
 
 
462 aa  126  3e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  34.36 
 
 
224 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.21 
 
 
502 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.68 
 
 
462 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  31.88 
 
 
473 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  31.88 
 
 
473 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
462 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  36.65 
 
 
476 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  35.87 
 
 
313 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.04 
 
 
464 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  35.03 
 
 
303 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.18 
 
 
464 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.9 
 
 
479 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  34.93 
 
 
474 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.1 
 
 
458 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  34.66 
 
 
303 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.72 
 
 
626 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  32.99 
 
 
464 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.55 
 
 
554 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  34.64 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.68 
 
 
528 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  34.66 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  34.66 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  34.66 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  34.59 
 
 
467 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  29.61 
 
 
314 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  33.5 
 
 
464 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  32.97 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  36.2 
 
 
182 aa  118  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  35.2 
 
 
303 aa  118  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  31.88 
 
 
470 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  34.18 
 
 
457 aa  118  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  34.08 
 
 
303 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  32.77 
 
 
303 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  34.07 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  34.18 
 
 
457 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  34.18 
 
 
457 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  34.18 
 
 
457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.18 
 
 
457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  34.18 
 
 
457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  36.13 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  34.18 
 
 
457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  34.18 
 
 
457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  34.18 
 
 
457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  28.79 
 
 
321 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  32.77 
 
 
303 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  32.2 
 
 
303 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  34.34 
 
 
303 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  32.77 
 
 
303 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  33.33 
 
 
457 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  32.51 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  33.16 
 
 
457 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  34.87 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  34.15 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  32.65 
 
 
457 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.04 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.33 
 
 
481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  31.28 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  32.65 
 
 
459 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  32.14 
 
 
457 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.86 
 
 
482 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>