123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0682 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0682  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 		 60 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000753402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  73.91 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  65.31 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  51.72 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  50.94 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  54 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  49.12 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  54 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  55.1 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.33 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  42.37 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.76 
 
 		 55 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  44.07 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  40.35 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  40.35 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.59 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  46.27 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  48.33 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  52.31 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.07 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.92 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.62 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.22 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.48 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  55.26 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  55.26 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.31 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  48.89 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  51.22 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.82 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.835870000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.9 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  47.5 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.09 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.92 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.26 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  40.38 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1117  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.24 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  35.85 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.69 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  34.55 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  47.37 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28.57 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  36.67 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3049  twin arginine translocase protein A  62 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.15 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  39.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  36.73 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  47.83 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.47 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  40.82 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  38.46 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.44 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1119  twin arginine-targeting protein translocase  56.25 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.35 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2641  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1201  twin arginine translocase protein A  62 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.84 
 
 		 79 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  33.93 
 
 		 83 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>