More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0639 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 290 aa  590  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.91 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.9 
 
 		 267 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 		 283 aa  215  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 		 269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  46.13 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  41.51 
 
 		 264 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.61 
 
 		 260 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  45.29 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  45.6 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  39.55 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.68 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  46.07 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  43.38 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  43.33 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  40.21 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 266 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.2 
 
 		 266 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  44.57 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  45.2 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 		 268 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  45.2 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  43.87 
 
 		 267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  42.96 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  38.81 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  45.65 
 
 		 268 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  44.6 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.35 
 
 		 288 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.35 
 
 		 288 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.01 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  39.26 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  43.96 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.67 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  36.16 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 267 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  40.61 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  39.49 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  42.12 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  43.22 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  43.22 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 		 449 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  46.13 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  41.4 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  42.96 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  37.36 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  42.51 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  40.43 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>