153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0608 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0608  phosphopentomutase  100 
 
 		 390 aa  798    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  59.38 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  60.57 
 
 		 388 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  57.36 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  56.78 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  60.05 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  60.05 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  57.96 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  56.14 
 
 		 388 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  56.56 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  57.55 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  58.67 
 
 		 389 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  54.4 
 
 		 389 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  54.83 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  54.08 
 
 		 392 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  53.91 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  53.63 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  52.42 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  54.29 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  48.07 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  52.14 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  51.79 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  50.53 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  51.53 
 
 		 388 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  49.73 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  51.03 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  50.4 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  51.05 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  48.99 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  49.74 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  50.27 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  49.74 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  51.03 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  45.97 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  48.44 
 
 		 392 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  45.57 
 
 		 392 aa  348  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  45.57 
 
 		 392 aa  348  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  44.79 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  45.04 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  46.11 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0150  phosphopentomutase  47.72 
 
 		 381 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.51514  normal  0.178171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2846  phosphopentomutase  47.72 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  46.49 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  45.59 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  46.8 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  44.85 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  44.03 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  44.03 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  45.81 
 
 		 406 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  44.99 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2446  phosphopentomutase  46.58 
 
 		 401 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.892487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  44.39 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  44.39 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  44.39 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  43.5 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  43.77 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  43.77 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  44.31 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  43.93 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  43.77 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  44.33 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  43.84 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  43.52 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  44.99 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  43.14 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  43.77 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  43.32 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  43.32 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  43.98 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  43.32 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  43.32 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  43.32 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  43.32 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  43.32 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  42.22 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  43.64 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  43.07 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  43.07 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  42.72 
 
 		 405 aa  298  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  42.01 
 
 		 406 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  42.89 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  43.75 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  42.89 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  43.14 
 
 		 407 aa  295  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  43.07 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  41.77 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  42.39 
 
 		 407 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  42.39 
 
 		 407 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  42.39 
 
 		 407 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  42.39 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  42.39 
 
 		 407 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  42.58 
 
 		 406 aa  292  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>