More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0597 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  58.05 
 
 
180 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  53.98 
 
 
178 aa  197  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  53.67 
 
 
177 aa  191  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  49.41 
 
 
178 aa  184  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  48.86 
 
 
182 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
183 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
180 aa  175  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  50 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  47.43 
 
 
179 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  47.7 
 
 
176 aa  167  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
179 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 
186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  47.7 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  47.7 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  47.7 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  47.7 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  47.7 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  47.7 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  47.7 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  47.7 
 
 
179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  47.7 
 
 
179 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 
183 aa  157  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 
176 aa  155  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  40.57 
 
 
185 aa  151  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  45.61 
 
 
180 aa  150  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
281 aa  148  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  43.37 
 
 
176 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  39.08 
 
 
187 aa  141  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  41.14 
 
 
210 aa  140  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  42.77 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  42.07 
 
 
171 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 
199 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 
209 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 
209 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 
211 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 
199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
194 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
211 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 
190 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
180 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 
209 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
180 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  43.53 
 
 
189 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  42.01 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
212 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 
183 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  44.51 
 
 
194 aa  131  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
176 aa  131  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
215 aa  130  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  43.33 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  37.93 
 
 
205 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  40.8 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
196 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
213 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
204 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
196 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
179 aa  124  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  37.95 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
184 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
196 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
172 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
196 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
194 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
171 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.87 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.87 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.87 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.87 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  37.87 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  37.87 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  40.72 
 
 
207 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
178 aa  121  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.87 
 
 
196 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.28 
 
 
196 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
204 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
183 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
189 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  36 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>