More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0575 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  100 
 
 		 459 aa  897    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  32.13 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  31.21 
 
 		 469 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  32.8 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  36.92 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  33.65 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  30.29 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  36.46 
 
 		 468 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 475 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  33.67 
 
 		 462 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 447 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  32.34 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  31.74 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.33 
 
 		 466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  27.6 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  27.56 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  27.56 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  27.56 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 498 aa  144  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 459 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 459 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 459 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  26.86 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1890  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  29 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 462 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  29 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  28 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  21.95 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.15 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.64 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 444 aa  139  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.15 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 467 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.12 
 
 		 547 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.12 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.12 
 
 		 547 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 450 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.27 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.95 
 
 		 546 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  30.34 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  27.42 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  30.34 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  27.84 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.78 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 464 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 464 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.88 
 
 		 464 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 464 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  27.42 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1656  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.737178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  23.69 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.9 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>