More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0558 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  59.63 
 
 
634 aa  793    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000214042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1525  pyruvate carboxylase subunit B  57.59 
 
 
643 aa  780    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000118935  normal  0.0137179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3508  pyruvate carboxylase subunit B  56.64 
 
 
621 aa  742    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000543633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  59.75 
 
 
624 aa  795    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000143186  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  60.7 
 
 
614 aa  785    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0558  pyruvate carboxylase subunit B  100 
 
 
636 aa  1308    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0745803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1284  pyruvate carboxylase subunit B  59.84 
 
 
618 aa  766    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.01303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1582  oxaloacetate decarboxylase  59.78 
 
 
465 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2542  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  46.05 
 
 
629 aa  585  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.332084  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05220  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  46.67 
 
 
634 aa  580  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  59.24 
 
 
475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  48.51 
 
 
567 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0701  oxaloacetate decarboxylase  58.07 
 
 
465 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  46.45 
 
 
573 aa  555  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07970  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  47.34 
 
 
626 aa  557  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000057905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1736  oxaloacetate decarboxylase  59.05 
 
 
510 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  44.43 
 
 
633 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  46.26 
 
 
604 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  59.28 
 
 
602 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  46.39 
 
 
602 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  47.39 
 
 
607 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  47.23 
 
 
607 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  45.08 
 
 
602 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  47.44 
 
 
599 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  46.77 
 
 
602 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  46.68 
 
 
602 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  45.58 
 
 
582 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  55.53 
 
 
569 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  46.52 
 
 
602 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  55.75 
 
 
569 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  45.08 
 
 
602 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  56.76 
 
 
567 aa  532  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  55.97 
 
 
569 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  46.77 
 
 
602 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  44.77 
 
 
602 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  54.88 
 
 
568 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  57.89 
 
 
571 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  44.65 
 
 
584 aa  521  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1319  Conserved carboxylase region  55.1 
 
 
463 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  44.62 
 
 
609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  44.95 
 
 
587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  45.51 
 
 
577 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  43.4 
 
 
616 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  43.01 
 
 
617 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  44.08 
 
 
597 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  43.64 
 
 
599 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2433  oxaloacetate decarboxylase  54.95 
 
 
470 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  54.61 
 
 
582 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  43.68 
 
 
596 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  42.52 
 
 
596 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  43.12 
 
 
598 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  43.73 
 
 
595 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  53.32 
 
 
582 aa  495  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  42.99 
 
 
599 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  53.52 
 
 
579 aa  498  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  43.24 
 
 
594 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  42.34 
 
 
605 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  53.88 
 
 
608 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  41.94 
 
 
599 aa  492  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  43.19 
 
 
590 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  43.19 
 
 
590 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  51 
 
 
595 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  42.72 
 
 
615 aa  492  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  43.19 
 
 
590 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  41.69 
 
 
607 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  41.19 
 
 
606 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  41.47 
 
 
608 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  43.57 
 
 
594 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  41.63 
 
 
604 aa  485  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1435  Pyruvate carboxylase  52.03 
 
 
507 aa  486  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  43.19 
 
 
589 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  53.03 
 
 
596 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  53.03 
 
 
596 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  43.04 
 
 
589 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  42.88 
 
 
589 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  43.35 
 
 
589 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  51.74 
 
 
602 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  41.09 
 
 
602 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  41.6 
 
 
604 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  50.87 
 
 
592 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0819  oxaloacetate decarboxylase  53.35 
 
 
462 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  43.04 
 
 
589 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  42.57 
 
 
591 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3026  oxaloacetate decarboxylase  51.07 
 
 
520 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.444345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  41.44 
 
 
603 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0796  oxaloacetate decarboxylase  53 
 
 
462 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  42.81 
 
 
591 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  42.57 
 
 
591 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  41.25 
 
 
604 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  50.99 
 
 
577 aa  476  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  42.88 
 
 
588 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  51.21 
 
 
594 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  51.32 
 
 
593 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  40.6 
 
 
601 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1755  oxaloacetate decarboxylase  51.95 
 
 
461 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  40.9 
 
 
611 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1864  oxaloacetate decarboxylase  52.76 
 
 
458 aa  475  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00728685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0033  oxaloacetate decarboxylase  52.58 
 
 
499 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000614565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3084  oxaloacetate decarboxylase  52.58 
 
 
499 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  40.63 
 
 
592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>