More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0461 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  44.57 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  43.82 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  45.88 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  41.57 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  46.25 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  46.25 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  43.82 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  40.45 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2187  hypothetical protein  45.56 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  45.56 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  51.35 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  44.05 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  45.88 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  45.88 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  40.45 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  41.46 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  41.46 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  39.33 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  49.37 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  42.35 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  44.32 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  44.32 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  44.71 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  42.35 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  47.06 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  39.56 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  77  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  43.37 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  40.7 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  42.5 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  41.38 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  44.71 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  43.21 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  42.35 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  42.35 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  42.35 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  41.18 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  40.7 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  41.86 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  45.68 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  45.83 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  39.77 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  39.53 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  41.86 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  40.7 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  39.53 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  44.59 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  42.35 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  44.19 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  43.21 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  44.71 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  37.36 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  41.11 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  49.23 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  42.35 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  42.35 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  41.57 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  45.57 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  40.23 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  38.37 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  37.08 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  40.91 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  46.88 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  50.82 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  43.21 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  40.74 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  44.87 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  40.74 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  41.98 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  37.36 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  39.08 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3786  hypothetical protein  41.03 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  47.37 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  40.74 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  45 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  35.23 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  38.82 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  38.27 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  38.82 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  41.98 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  35.23 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  39.24 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3638  hypothetical protein  36.96 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>