178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0455 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.61 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.06 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  41.14 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  41.83 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.25 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  41.29 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.08 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  34.59 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  34.59 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  34.59 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  31.45 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  33.96 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  33.96 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  33.96 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  33.96 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.77 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.06 
 
 		 178 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  33.96 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  46 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  33.96 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.45 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.84 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  32.08 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  33.55 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  33.33 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  37.21 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.06 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  29.63 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.01 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.09 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  32.21 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  36.13 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.08 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  33.53 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  32.93 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.01 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  35.9 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  34.35 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.82 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.77 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  31.48 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  31.48 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  43.21 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  34.19 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  29.76 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.75 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  33.12 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  32.58 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  31.36 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  32.91 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  33.54 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  32.61 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.8 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  31.1 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.1 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  31.14 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  29.94 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  30.36 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.56 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.93 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  32.93 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  32.7 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  28.81 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  33.99 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  33.58 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  31.79 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.56 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.63 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.9 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.08 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.63 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  28.31 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.5 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.83 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.12 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.34 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  30.66 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  30.18 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.85 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>