More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0438 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  685  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  44.63 
 
 
324 aa  289  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  44.13 
 
 
323 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  41.49 
 
 
323 aa  270  3e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
325 aa  262  7e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  41.99 
 
 
322 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 
350 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
862 aa  190  3e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 
310 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 
328 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
337 aa  164  2e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.6 
 
 
352 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 
327 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
332 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.34 
 
 
348 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
368 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
324 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
324 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  34.54 
 
 
322 aa  134  2e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
339 aa  134  2e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.66 
 
 
363 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
354 aa  130  4e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 
324 aa  128  1e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 
329 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.24 
 
 
354 aa  127  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
314 aa  127  4e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 
321 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.65 
 
 
346 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
320 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 
351 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
331 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 
329 aa  118  1e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 
321 aa  117  2e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  30.34 
 
 
354 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
354 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  28.16 
 
 
335 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  30.67 
 
 
331 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  27.83 
 
 
348 aa  112  1e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
366 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  30.37 
 
 
354 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 
334 aa  109  7e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 
340 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  28.94 
 
 
359 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 
346 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  26.23 
 
 
357 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  28.83 
 
 
354 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.13 
 
 
334 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 
359 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
359 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
334 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
335 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  27.42 
 
 
353 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  29.47 
 
 
341 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  29.62 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  30.4 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  28.35 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  30.4 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  30.4 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.4 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 
359 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  30.4 
 
 
383 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
334 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  27.33 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  27.33 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 
359 aa  96.3  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.73 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  26.73 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.73 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.53 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 
352 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  29.03 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  28.53 
 
 
384 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
357 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  28.53 
 
 
358 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  31.03 
 
 
326 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  28.12 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.43 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  26.27 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
371 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
356 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
307 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 
369 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>