262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0436 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0436  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  100 
 
 
446 aa  927    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1014  hypothetical protein  73.15 
 
 
447 aa  694    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  56.95 
 
 
447 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  57.75 
 
 
445 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  56.85 
 
 
445 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  56.53 
 
 
446 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  57.11 
 
 
447 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.41 
 
 
446 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.93 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.61 
 
 
447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0787  hypothetical protein  55.83 
 
 
447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1147  hypothetical protein  53.59 
 
 
449 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2025  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.45 
 
 
449 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000691604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1932  hypothetical protein  53.85 
 
 
447 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.15 
 
 
448 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0382  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.36 
 
 
448 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1350  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.65 
 
 
447 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.335116  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0577  4-hydroxybutyrate CoA transferase (cat2-1)  45.99 
 
 
444 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537722  hitchhiker  0.000215809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.73 
 
 
428 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.06 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.91 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.35 
 
 
479 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.81 
 
 
437 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.68 
 
 
455 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.01 
 
 
431 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.1 
 
 
437 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.41 
 
 
431 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40 
 
 
424 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.33 
 
 
407 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.74 
 
 
437 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  38.17 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.77 
 
 
616 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.32 
 
 
616 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.72 
 
 
424 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.61 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.99 
 
 
434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.72 
 
 
424 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.43 
 
 
437 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.49 
 
 
424 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.39 
 
 
441 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.61 
 
 
445 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  37.79 
 
 
431 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.98 
 
 
437 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.98 
 
 
431 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.65 
 
 
645 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.86 
 
 
420 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.95 
 
 
442 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.65 
 
 
428 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.32 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.12 
 
 
617 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.35 
 
 
428 aa  273  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.64 
 
 
437 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.41 
 
 
443 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.29 
 
 
428 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  37.41 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  37.41 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.41 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  37.41 
 
 
445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.95 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  37.41 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.41 
 
 
443 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  37.41 
 
 
443 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.61 
 
 
431 aa  270  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.28 
 
 
431 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.29 
 
 
428 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.95 
 
 
433 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.15 
 
 
427 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.28 
 
 
441 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.94 
 
 
428 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.17 
 
 
449 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.94 
 
 
449 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.23 
 
 
428 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.51 
 
 
430 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.84 
 
 
440 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.84 
 
 
440 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.84 
 
 
440 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.64 
 
 
428 aa  259  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.47 
 
 
428 aa  259  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.16 
 
 
432 aa  259  9e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.85 
 
 
441 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.85 
 
 
441 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.85 
 
 
441 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.85 
 
 
441 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.35 
 
 
428 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.14 
 
 
614 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.35 
 
 
428 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.35 
 
 
428 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  34.55 
 
 
431 aa  256  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.35 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.99 
 
 
432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.18 
 
 
627 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  34.54 
 
 
432 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.68 
 
 
430 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36 
 
 
429 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.64 
 
 
428 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.71 
 
 
428 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.71 
 
 
634 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  38.35 
 
 
615 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.11 
 
 
611 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.26 
 
 
634 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>