74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0431 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  100 
 
 		 442 aa  924    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  30.67 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  30.97 
 
 		 754 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  28.51 
 
 		 719 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  30.53 
 
 		 728 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  27.52 
 
 		 614 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  27.03 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  27.55 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  29.66 
 
 		 589 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  29.82 
 
 		 747 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  26.99 
 
 		 629 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.55 
 
 		 632 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  26.99 
 
 		 629 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  25.8 
 
 		 465 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  25.11 
 
 		 750 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  26.1 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  26.1 
 
 		 647 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  29.95 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.25 
 
 		 619 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  28.68 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  31.14 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  24.29 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  23.26 
 
 		 858 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  26.05 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  25.31 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  32.18 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  22.31 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  26.43 
 
 		 671 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  26.16 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  24.29 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  25.25 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  26.48 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  24.57 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  29.73 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.4 
 
 		 750 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  22.67 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  41.18 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  29.45 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  25.95 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  32.65 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  25.97 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  21.05 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  21.05 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  31.93 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  21.05 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  23.47 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  27.67 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  25.65 
 
 		 581 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  27.27 
 
 		 524 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  28.09 
 
 		 651 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  40 
 
 		 596 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  24.42 
 
 		 647 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  34.82 
 
 		 590 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.4 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  24.56 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  30.99 
 
 		 668 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  26.05 
 
 		 664 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  27.84 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  23.23 
 
 		 601 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  29.81 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  23.89 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  24.08 
 
 		 557 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  25.97 
 
 		 672 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1122 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  27.01 
 
 		 529 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  29.29 
 
 		 583 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  34.29 
 
 		 631 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  24.31 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  25.33 
 
 		 700 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  22.58 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  26.13 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  25.24 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  21.63 
 
 		 541 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  24.37 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>