More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0417 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 357 aa  742    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  42.57 
 
 		 375 aa  315  8e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  42.74 
 
 		 372 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  40.52 
 
 		 363 aa  275  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  36.29 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  35.43 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  35.84 
 
 		 363 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  36.42 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  32.86 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  29.86 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.64 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.87 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.59 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.87 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.35 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.06 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  30.19 
 
 		 556 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.67 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.38 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.15 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.3 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.64 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.33 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  28.22 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  25.71 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  27.37 
 
 		 617 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.65 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.14 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  24.28 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  27.36 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  27.48 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.79 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.86 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  27.81 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  28.89 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.35 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.85 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  30.45 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  27.76 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  26.77 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  26.38 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  25.36 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  27.93 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  25.89 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  29.81 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  28.1 
 
 		 314 aa  97.8  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  25.43 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  25.73 
 
 		 352 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  25.08 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  24.92 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  25.8 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  26.49 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  24.35 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  24.38 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  22.46 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  27.01 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  25.73 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  24.09 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  27.04 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  27.48 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  24.17 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  24.68 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  26.06 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  26.04 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  26.12 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  25.41 
 
 		 380 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  25.16 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  25.08 
 
 		 355 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  24.43 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  27.2 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  25.08 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  26.39 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  25.32 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  25.47 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  26.91 
 
 		 350 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.27 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  25.08 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  25.08 
 
 		 346 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  25.43 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  25.42 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  27.33 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  25.89 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  25 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  25.43 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  24.1 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  24.14 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  28.46 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  24.05 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  24.22 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  28.46 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  27.07 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  24.55 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00030  uroporphyrinogen decarboxylase, putative  26.13 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000569927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  25.41 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>