More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0409 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  100 
 
 		 365 aa  748    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  59.02 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  57.92 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  55.71 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  55.62 
 
 		 371 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  57.34 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  55.14 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  56.1 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  55.16 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  56.4 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  54.17 
 
 		 366 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  53.64 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  55.56 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  55.56 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  54.12 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  54.32 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.55 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  54.05 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  53.66 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  50.13 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  49.87 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  53.39 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.59 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.8 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  53.24 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.43 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  53.1 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  53.1 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.43 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.61 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.43 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  52.83 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  53.83 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  54.18 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  53.24 
 
 		 367 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  51.63 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.02 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  52.43 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.68 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  53.15 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  53.15 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.49 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  53.15 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  53.3 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.42 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.18 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.35 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  53.3 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  51.37 
 
 		 380 aa  368  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  49.74 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.62 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  50 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49.6 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  48.09 
 
 		 371 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  48.09 
 
 		 371 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  51.63 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.39 
 
 		 379 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.55 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  47.49 
 
 		 398 aa  359  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50.82 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  57.73 
 
 		 410 aa  358  6e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.39 
 
 		 372 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  49.18 
 
 		 384 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 372 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 372 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 372 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  48.12 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  56.9 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 406 aa  356  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  47.71 
 
 		 372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  47.71 
 
 		 372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  47.71 
 
 		 372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  48.63 
 
 		 384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  50.54 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  49.18 
 
 		 384 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  49.31 
 
 		 371 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  48.36 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  55.08 
 
 		 380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.04 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>