More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0342 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  100 
 
 		 551 aa  1108    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  36.64 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  36.28 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  35.3 
 
 		 561 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.62 
 
 		 561 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  36.8 
 
 		 557 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.15 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  37.79 
 
 		 558 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  34.75 
 
 		 561 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  35.69 
 
 		 559 aa  342  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.48 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.88 
 
 		 559 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  36.56 
 
 		 558 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.07 
 
 		 558 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.05 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  34.25 
 
 		 581 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  35.96 
 
 		 557 aa  329  8e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.14 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  36.26 
 
 		 562 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  34.81 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  34.95 
 
 		 556 aa  326  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.73 
 
 		 559 aa  326  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.14 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  34.25 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.53 
 
 		 584 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  32.74 
 
 		 571 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  35.44 
 
 		 582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.57 
 
 		 563 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.15 
 
 		 558 aa  313  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.19 
 
 		 557 aa  313  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.3 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.73 
 
 		 592 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  32.12 
 
 		 560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  35.98 
 
 		 544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  34.23 
 
 		 565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  33.74 
 
 		 591 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  34.75 
 
 		 582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.04 
 
 		 573 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  31.85 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  36.86 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  36 
 
 		 582 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  33.03 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  34.19 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  34.92 
 
 		 543 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  32.72 
 
 		 560 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  36 
 
 		 558 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  34.92 
 
 		 556 aa  297  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  35.19 
 
 		 544 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  35.54 
 
 		 565 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  35.54 
 
 		 565 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.72 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.23 
 
 		 558 aa  292  9e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.17 
 
 		 549 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.1 
 
 		 559 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.66 
 
 		 555 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.26 
 
 		 585 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  34.26 
 
 		 578 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.66 
 
 		 571 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  35.84 
 
 		 544 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  32.61 
 
 		 584 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 561 aa  283  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  32.61 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  33.82 
 
 		 565 aa  279  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  32.48 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.84 
 
 		 599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  35.04 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  31.53 
 
 		 549 aa  269  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  34.16 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  32.2 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  35.41 
 
 		 546 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  32.2 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  35.77 
 
 		 659 aa  267  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  34.36 
 
 		 560 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.52 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  35.58 
 
 		 666 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.68 
 
 		 550 aa  263  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  32.42 
 
 		 537 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  32.38 
 
 		 549 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  33.21 
 
 		 537 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  30.71 
 
 		 559 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.54 
 
 		 557 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.85 
 
 		 555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.33 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  32.54 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  31.54 
 
 		 560 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  34.13 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  32.01 
 
 		 549 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  32.63 
 
 		 545 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  30.27 
 
 		 549 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  33.56 
 
 		 542 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.25 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  32.03 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30.09 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.6 
 
 		 557 aa  247  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  32.48 
 
 		 557 aa  246  6e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  29.06 
 
 		 556 aa  246  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  31.78 
 
 		 556 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  31.74 
 
 		 566 aa  246  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.7 
 
 		 547 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  28.6 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>