182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0333 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0333  phosphatase  100 
 
 
176 aa  360  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000279667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0394  Appr-1-p processing domain protein  64.71 
 
 
175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0342747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0314  appr-1-p processing domain-containing protein  63.1 
 
 
175 aa  223  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2547  Appr-1-p processing domain protein  60.74 
 
 
181 aa  210  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0659  Appr-1-p processing  57.74 
 
 
179 aa  201  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.55693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1246  Appr-1-p processing domain protein  53.89 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.07141  normal  0.0339932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0121  Appr-1-p processing domain protein  55.29 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0422  appr-1-p processing domain-containing protein  55.97 
 
 
177 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0191366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0909  appr-1-p processing domain-containing protein  51.81 
 
 
181 aa  177  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0449366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  52.15 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  51.46 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  52.12 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  50.3 
 
 
195 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  48.24 
 
 
175 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  51.52 
 
 
177 aa  158  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  50.6 
 
 
173 aa  157  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  45.18 
 
 
173 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  54.37 
 
 
174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  47.16 
 
 
176 aa  151  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  49.41 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  52.07 
 
 
166 aa  150  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  49.4 
 
 
171 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  47.06 
 
 
175 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  48.17 
 
 
181 aa  148  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  50 
 
 
173 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  48.54 
 
 
183 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  52.94 
 
 
171 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  52.33 
 
 
184 aa  147  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  53.52 
 
 
194 aa  147  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  52.8 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  52.29 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  50.32 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  45.03 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0425  appr-1-p processing domain-containing protein  45.03 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  45.03 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  45.88 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 
177 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  49.4 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  45.78 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  54.73 
 
 
173 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
174 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
174 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  49.68 
 
 
183 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0319  Appr-1-p processing  48.78 
 
 
183 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  49.4 
 
 
174 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  49.4 
 
 
174 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  49.7 
 
 
177 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  46.51 
 
 
188 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  52.7 
 
 
172 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  42.68 
 
 
167 aa  141  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  48.48 
 
 
163 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  47.85 
 
 
177 aa  141  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  48.03 
 
 
177 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  45.66 
 
 
170 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  50.9 
 
 
173 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  55.07 
 
 
170 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  47.83 
 
 
173 aa  140  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1715  Appr-1-p processing domain protein  46.47 
 
 
184 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  49.38 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  47.37 
 
 
197 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  50 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  52.7 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  44.89 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  49.12 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  49.38 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5311  Appr-1-p processing domain protein  45.22 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503584  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  47.33 
 
 
182 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  47.98 
 
 
179 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2909  appr-1-p processing domain-containing protein  47.77 
 
 
170 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.429439  normal  0.528204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  48.48 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  48.45 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  48.54 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  41.99 
 
 
180 aa  137  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  48.19 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  48.81 
 
 
179 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  49.12 
 
 
177 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  49.12 
 
 
188 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1600  Appr-1-p processing  59.68 
 
 
180 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799444  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  49.12 
 
 
177 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  49.12 
 
 
177 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  49.12 
 
 
188 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  49.12 
 
 
188 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  48.81 
 
 
179 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0633  appr-1-p processing domain-containing protein  47.95 
 
 
172 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  48.81 
 
 
179 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  47.65 
 
 
185 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  48.21 
 
 
179 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  52.45 
 
 
171 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  48.21 
 
 
179 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1928  Appr-1-p processing  46.88 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913427  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  47.16 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2593  Appr-1-p processing domain protein  45.61 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1884  appr-1-p processing domain-containing protein  47.9 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0289844  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1166  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096978  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  46.01 
 
 
374 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01042  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0729  appr-1-p processing domain-containing protein  44.31 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2086  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.293487  normal  0.23556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2554  hypothetical protein  48.24 
 
 
177 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.703026  normal  0.227218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>