277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0324 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  64.36 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  53.41 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  48.1 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  51.18 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  53.45 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  54.9 
 
 		 330 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  51.7 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  47.27 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  47.91 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  48.3 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  47.96 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  46.6 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  45.98 
 
 		 298 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  48.46 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  46.18 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  49.14 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  49.14 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  46.88 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  48.04 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  47.59 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  47.49 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  47.85 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  52.71 
 
 		 640 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.49 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  46.18 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  44.15 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  49.83 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  49.83 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  48.97 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  46.96 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  46.51 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.69 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.75 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  45.33 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.29 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  44.64 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.94 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.04 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  40.75 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  45.49 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  43.3 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  41.46 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  41.14 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  43.69 
 
 		 327 aa  195  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  45.09 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.13 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  39.21 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  38.51 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 329 aa  175  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.67 
 
 		 584 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  43.22 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  59.8 
 
 		 120 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  23.62 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  27.75 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  30 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  30.81 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  30.81 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  25.78 
 
 		 372 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  25.71 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  26.87 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  28.91 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1363  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  26.39 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  29.44 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>