41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0283 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  22.12 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  24.55 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  30.59 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  25.86 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  27.91 
 
 		 172 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 149 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 143 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  35.29 
 
 		 173 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  27.96 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1345  transcriptional regulator, MarR family  21.57 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>