More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0254 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 601 aa  1231    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  44.89 
 
 		 613 aa  521  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  43.16 
 
 		 624 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  44.26 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  40.89 
 
 		 607 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  43.97 
 
 		 622 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  43.17 
 
 		 588 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  41.1 
 
 		 685 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  40.19 
 
 		 641 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 625 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  42.25 
 
 		 653 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  39.21 
 
 		 638 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 607 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.13 
 
 		 607 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.54 
 
 		 614 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  38.91 
 
 		 604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 617 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 617 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.02 
 
 		 607 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  40.26 
 
 		 708 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 671 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 624 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  38.47 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  38.4 
 
 		 622 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 656 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  39.18 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.2 
 
 		 619 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  38.13 
 
 		 628 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  42.52 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.5 
 
 		 616 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 		 640 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 		 643 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 615 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 640 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  39.49 
 
 		 658 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  39.35 
 
 		 631 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 		 646 aa  425  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  37.17 
 
 		 679 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  39.08 
 
 		 613 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 676 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 676 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  38.33 
 
 		 649 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  37.73 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  39.15 
 
 		 641 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 676 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  37.72 
 
 		 675 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 628 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.24 
 
 		 628 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 625 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  37.72 
 
 		 647 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  37.15 
 
 		 665 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 		 678 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  38.3 
 
 		 670 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 678 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.34 
 
 		 607 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 594 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  37.08 
 
 		 669 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 		 629 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  36.64 
 
 		 644 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  37.42 
 
 		 649 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 666 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.7 
 
 		 594 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 594 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 594 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 594 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 		 591 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  38.8 
 
 		 659 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 		 665 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 627 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.8 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 		 614 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 596 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  37.38 
 
 		 660 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 		 617 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  37.7 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  36.01 
 
 		 675 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 643 aa  402  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  38.08 
 
 		 611 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  38.35 
 
 		 737 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  37.4 
 
 		 682 aa  398  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1115  excinuclease ABC subunit C  35.73 
 
 		 679 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.86041  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 661 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 674 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  37.4 
 
 		 693 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  39.63 
 
 		 620 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  37.83 
 
 		 666 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 652 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>