More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0248 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  100 
 
 		 389 aa  783    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  43.63 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  41.64 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  40.81 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  37.87 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 441 aa  255  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  40.23 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.73 
 
 		 426 aa  249  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  42.94 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.72 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  38.62 
 
 		 515 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  40.55 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  41.16 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  42.34 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  38.04 
 
 		 521 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  41.25 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  43.28 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  37.75 
 
 		 515 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  42.04 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  39.2 
 
 		 479 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  37.6 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 		 476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  36.13 
 
 		 477 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  41.56 
 
 		 445 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 481 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  41.72 
 
 		 425 aa  242  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 513 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 530 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  42.56 
 
 		 427 aa  242  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  36.89 
 
 		 530 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 524 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  39.77 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  37.43 
 
 		 526 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 511 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  36.89 
 
 		 524 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  36.89 
 
 		 524 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 522 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  36.89 
 
 		 524 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  39.76 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  36.89 
 
 		 524 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  40.64 
 
 		 478 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  40.74 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  36.32 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  39.53 
 
 		 480 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  36.61 
 
 		 455 aa  238  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  36.5 
 
 		 532 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  37.8 
 
 		 468 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  40 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  40 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 468 aa  236  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.21 
 
 		 441 aa  235  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  39.61 
 
 		 490 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.8 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  41.32 
 
 		 447 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.8 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  34.24 
 
 		 549 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  40.81 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 		 429 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 		 456 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 		 410 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  44.63 
 
 		 450 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  37.99 
 
 		 461 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  39.46 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  38.79 
 
 		 480 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  40.94 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38.91 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  36.9 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38.91 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  38.53 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.33 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  37.06 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 437 aa  230  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  35.26 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 		 476 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  43.19 
 
 		 446 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.2 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.63 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 		 538 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  39.09 
 
 		 451 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.34 
 
 		 451 aa  229  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>