More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0247 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  100 
 
 
379 aa  775    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  37.13 
 
 
374 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.32 
 
 
376 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  39.13 
 
 
377 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  38.1 
 
 
379 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  36.68 
 
 
372 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  36.39 
 
 
374 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  38.42 
 
 
375 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  33.87 
 
 
379 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  34.07 
 
 
377 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  34.72 
 
 
375 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  32.66 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  34.32 
 
 
373 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  33.91 
 
 
400 aa  202  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  34.01 
 
 
412 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  35.48 
 
 
404 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  28.71 
 
 
431 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  29.61 
 
 
441 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  30.05 
 
 
399 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  30.05 
 
 
399 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  37.05 
 
 
375 aa  176  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  30.79 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  32.25 
 
 
411 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  29.93 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  29.93 
 
 
397 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  28.07 
 
 
394 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.32 
 
 
391 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.8 
 
 
398 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  56.15 
 
 
541 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  47.44 
 
 
282 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  26.99 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  31.68 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  26.85 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  53.28 
 
 
538 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  48.05 
 
 
452 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  25.2 
 
 
404 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  30.08 
 
 
419 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.29 
 
 
305 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31.62 
 
 
301 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  56 
 
 
430 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  51.61 
 
 
309 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  28.61 
 
 
377 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  28.61 
 
 
377 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  29.64 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  29.18 
 
 
432 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  32.48 
 
 
398 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  25.27 
 
 
430 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  28.21 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.36 
 
 
423 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  27.08 
 
 
469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  26.68 
 
 
380 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  25.26 
 
 
387 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  27.34 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  33.76 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  28.19 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  28.04 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.83 
 
 
430 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  46.21 
 
 
324 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  42.93 
 
 
482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  26.74 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  47.54 
 
 
314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  53.57 
 
 
651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  44.59 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  54.05 
 
 
651 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  51.75 
 
 
683 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  54.05 
 
 
651 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42.33 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  27.2 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.33 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  44.35 
 
 
460 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  46.62 
 
 
445 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  47.01 
 
 
415 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  24.93 
 
 
366 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  46.55 
 
 
460 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.46 
 
 
456 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  41.72 
 
 
386 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.09 
 
 
446 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  45.97 
 
 
450 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  49.19 
 
 
442 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  50.86 
 
 
448 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  45.8 
 
 
216 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  36.32 
 
 
271 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  28.42 
 
 
372 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.09 
 
 
455 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  28.21 
 
 
370 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  51.24 
 
 
645 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  55.75 
 
 
648 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  45.67 
 
 
459 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.14 
 
 
443 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  44.53 
 
 
524 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  52.46 
 
 
646 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  47.79 
 
 
446 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  50.78 
 
 
824 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  44.38 
 
 
470 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  44.38 
 
 
509 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  51.3 
 
 
665 aa  122  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.09 
 
 
454 aa  122  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  44.38 
 
 
472 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  44.72 
 
 
499 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  44.38 
 
 
471 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>