156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0204 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  811    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  68.7 
 
 		 393 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  58.59 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  58.59 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  59.09 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  56.85 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  55.39 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  55.47 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  56.08 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  42.75 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  43.51 
 
 		 424 aa  342  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  40.2 
 
 		 411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  40.38 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  40.25 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  41.34 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  25.53 
 
 		 409 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.81 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  21.15 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  21.81 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.1 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  24.93 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  25.41 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  25.41 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.99 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  23.99 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.82 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.23 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  25.44 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  25.41 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  24.24 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.55 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.58 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  26.08 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.59 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  24.93 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  25.47 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  26.39 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  26.18 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.13 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.86 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  22.47 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  26.11 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  23.14 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25.07 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  23.72 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  24.59 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  25.34 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  23.97 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  26.36 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.76 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  25.96 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.23 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  21.55 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  24.59 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  24.59 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  22.95 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  21.41 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  25.68 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  26.02 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  24.12 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  23.71 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  24.73 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.73 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  21.75 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  22.19 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  23.17 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  25.27 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  21.75 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  24.51 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  23.33 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  20.87 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  25.42 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  23.4 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  23.4 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  23.4 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  23.4 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  30.11 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  23.4 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  23.4 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  23.4 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  25.27 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  29.88 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  22.8 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  23.18 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  24.16 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  23.96 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  21.25 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.8 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  25.14 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  21.14 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  25.27 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  28.49 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  24.57 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  22.85 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  21.46 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  25.94 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  25.28 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  23.48 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  28.43 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  23.5 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>