73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0199 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  100 
 
 
671 aa  1387    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  27.41 
 
 
618 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.89 
 
 
629 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  29.73 
 
 
604 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  29.32 
 
 
635 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  33.56 
 
 
578 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  27.65 
 
 
627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  28.46 
 
 
649 aa  135  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  27.67 
 
 
470 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  28.11 
 
 
626 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  26.47 
 
 
891 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  26.31 
 
 
648 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  30.14 
 
 
653 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  28.01 
 
 
629 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  28.88 
 
 
638 aa  127  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  26.65 
 
 
666 aa  124  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  25.71 
 
 
623 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  28.87 
 
 
638 aa  124  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  28.04 
 
 
654 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  30.05 
 
 
632 aa  120  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  30.9 
 
 
617 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.11 
 
 
616 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  28.91 
 
 
625 aa  114  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  25.7 
 
 
647 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  27.05 
 
 
661 aa  106  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  23.56 
 
 
626 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.41 
 
 
607 aa  98.2  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  27.23 
 
 
605 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  25.99 
 
 
605 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  24.46 
 
 
605 aa  91.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  28.24 
 
 
570 aa  89  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  25.67 
 
 
578 aa  82  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  25.57 
 
 
662 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  24.19 
 
 
608 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
839 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  20.87 
 
 
589 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  21.79 
 
 
656 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  22.2 
 
 
841 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  21.41 
 
 
702 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  21 
 
 
433 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  24.25 
 
 
821 aa  62.4  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.87 
 
 
758 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  27.27 
 
 
431 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  27.38 
 
 
833 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  24.05 
 
 
1179 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  26.01 
 
 
826 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 
826 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  23.62 
 
 
700 aa  58.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  23.1 
 
 
429 aa  57.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.22 
 
 
430 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  26.27 
 
 
435 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  26.27 
 
 
435 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  25 
 
 
824 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  25.58 
 
 
841 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  27.07 
 
 
812 aa  55.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  20.62 
 
 
826 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  20.62 
 
 
826 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  25.2 
 
 
837 aa  54.3  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  26.16 
 
 
825 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  24.62 
 
 
431 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  27.53 
 
 
441 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  23.98 
 
 
645 aa  48.9  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  22.62 
 
 
560 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  22.67 
 
 
820 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  27.5 
 
 
442 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  25.42 
 
 
442 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  19.68 
 
 
871 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  23.99 
 
 
823 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  21.96 
 
 
446 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  24.79 
 
 
509 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  23.65 
 
 
430 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  21.37 
 
 
671 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
822 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>