More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0181 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  100 
 
 
382 aa  787  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  61.83 
 
 
379 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  57.68 
 
 
376 aa  469  1e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  30.66 
 
 
399 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
391 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 
397 aa  154  3e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  27.27 
 
 
415 aa  154  3e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  26.98 
 
 
379 aa  140  4e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  28.4 
 
 
373 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 
370 aa  131  2e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
376 aa  128  2e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  26.34 
 
 
369 aa  120  4e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 
369 aa  118  1e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  23.78 
 
 
377 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
376 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 
395 aa  115  2e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
376 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
368 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 
375 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 
377 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
371 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
376 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.59 
 
 
372 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 
372 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 
372 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 
369 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 
376 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  24.27 
 
 
377 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  24.19 
 
 
368 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  24.19 
 
 
368 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  24.19 
 
 
368 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.34 
 
 
381 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
368 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  24.19 
 
 
368 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  24.19 
 
 
368 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 
390 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 
376 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  24.46 
 
 
368 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
368 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 
371 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.7 
 
 
379 aa  99.4  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 
367 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.33 
 
 
907 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.56 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  21.91 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  7.27606e-07 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  25 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.24 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  24.47 
 
 
901 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
368 aa  97.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  23.98 
 
 
911 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  23.87 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  23.35 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.98 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.3 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.31089e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  26.92 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  22.36 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  25 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 
377 aa  93.2  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
366 aa  92.8  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.25 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  25 
 
 
368 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
370 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
378 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  21.57 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.65 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  25.97 
 
 
994 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  25.74 
 
 
380 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  23.12 
 
 
929 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  23.6 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>