More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0116 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 
488 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 
510 aa  666    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 
499 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 
491 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 
489 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 
499 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  63.6 
 
 
489 aa  653    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 
499 aa  634    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1009    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 
494 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  61.35 
 
 
490 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 
494 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 
499 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 
499 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 
499 aa  609  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 
499 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 
489 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
515 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
515 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 
497 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
501 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
501 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 
495 aa  588  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
495 aa  586  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 
503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
494 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 
631 aa  566  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  56.08 
 
 
491 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
491 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
504 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 
492 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
505 aa  550  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
504 aa  548  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
508 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 
492 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
494 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
492 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
494 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
503 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
561 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
532 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
507 aa  538  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
496 aa  536  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
509 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
573 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
497 aa  538  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
496 aa  535  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
504 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
573 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 
494 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
496 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
496 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
501 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  52 
 
 
573 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
502 aa  528  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
501 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
508 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
505 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
502 aa  522  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
484 aa  524  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
503 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
502 aa  522  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
503 aa  522  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  53.52 
 
 
496 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
502 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
502 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
508 aa  519  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
499 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  53.32 
 
 
496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
506 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 
508 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
505 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
505 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
499 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
503 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
501 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  52.48 
 
 
505 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
509 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
489 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
505 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
505 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
505 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
505 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
505 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
505 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>