More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0105 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  100 
 
 
533 aa  1102    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  51.34 
 
 
528 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  50.29 
 
 
532 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  50.29 
 
 
529 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  46.79 
 
 
532 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  51.16 
 
 
541 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  50.38 
 
 
538 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  47.57 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  47.2 
 
 
515 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  46.54 
 
 
533 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  44.87 
 
 
534 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  46.62 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  44.99 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  45.79 
 
 
538 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  45.25 
 
 
531 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  43.92 
 
 
531 aa  435  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  44.15 
 
 
531 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  45.91 
 
 
535 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  43.73 
 
 
532 aa  428  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 
531 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 
535 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 
534 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  44.08 
 
 
531 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  43.54 
 
 
531 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  43.47 
 
 
579 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  46.23 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  44.51 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  43.41 
 
 
537 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  44.32 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  44.64 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  44.83 
 
 
522 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  43.23 
 
 
531 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  44.05 
 
 
531 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 
531 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  44.27 
 
 
525 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.94 
 
 
545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  42.67 
 
 
541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  44.74 
 
 
534 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  45.29 
 
 
538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  45.29 
 
 
538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  43.15 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  44.27 
 
 
863 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  42.32 
 
 
565 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 
523 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  44.21 
 
 
545 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  44.27 
 
 
534 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 
533 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 
528 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  43.91 
 
 
529 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  43.91 
 
 
529 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 
535 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  44.66 
 
 
529 aa  392  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  45.57 
 
 
847 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 
533 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 
518 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  44.75 
 
 
532 aa  389  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  44 
 
 
535 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 
541 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 
546 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
532 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  43.88 
 
 
529 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
533 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 
532 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  41.04 
 
 
571 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 
548 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 
528 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
532 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
527 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 
556 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  43.08 
 
 
533 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  42.52 
 
 
509 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 
509 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  43.92 
 
 
577 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 
509 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  42.39 
 
 
536 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 
509 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 
534 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  45.03 
 
 
516 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 
525 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  42.72 
 
 
509 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  42.72 
 
 
509 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.96 
 
 
532 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  41.93 
 
 
509 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  42.58 
 
 
533 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  40.52 
 
 
534 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42.58 
 
 
533 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  41.93 
 
 
509 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  41.52 
 
 
539 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0614  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
549 aa  374  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  42.52 
 
 
529 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
537 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  44.1 
 
 
867 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 
537 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  41.76 
 
 
550 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  42.17 
 
 
533 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  40.5 
 
 
555 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  41.1 
 
 
519 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 
537 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  42.08 
 
 
552 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  44.6 
 
 
502 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>