More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0090 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  42.61 
 
 
326 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  38.72 
 
 
305 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  36.36 
 
 
301 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  43.42 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  39.12 
 
 
296 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  39.52 
 
 
303 aa  175  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  33.87 
 
 
311 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0093  Ppx/GppA phosphatase  36.59 
 
 
296 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0133967  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  32.91 
 
 
310 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  32.68 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  32.89 
 
 
312 aa  146  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  34.31 
 
 
311 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  34.98 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  29.84 
 
 
319 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
314 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  35.92 
 
 
531 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  33.77 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  35.28 
 
 
531 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  35.92 
 
 
531 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  34.18 
 
 
318 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  33.65 
 
 
320 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  34.7 
 
 
318 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  37.42 
 
 
311 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  32.69 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  31.58 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  34.95 
 
 
327 aa  136  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.89 
 
 
305 aa  135  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  32.66 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  33.02 
 
 
568 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  31.89 
 
 
308 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  35.43 
 
 
513 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  33.66 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  35.06 
 
 
531 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  32.05 
 
 
323 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  31.23 
 
 
327 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  36.62 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  36.33 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  32.17 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  37.33 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  31.13 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  32.17 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
315 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  31 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  33.87 
 
 
545 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  32.06 
 
 
318 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  34.07 
 
 
502 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  31.88 
 
 
513 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  30.91 
 
 
331 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  32.24 
 
 
307 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  32.49 
 
 
315 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  33.12 
 
 
313 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
545 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
545 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  33.12 
 
 
544 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  31.65 
 
 
498 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  31.65 
 
 
498 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
366 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  28.81 
 
 
491 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  31.65 
 
 
498 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 
501 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  30.64 
 
 
321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  27.97 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 
319 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  34.21 
 
 
553 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  30.06 
 
 
333 aa  118  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  34.45 
 
 
513 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  30.29 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  34.37 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  33.97 
 
 
548 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  29.26 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  31.08 
 
 
501 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  29.26 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  29.61 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  32.15 
 
 
539 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  32.91 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  30.85 
 
 
507 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  29.58 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 
500 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  31.02 
 
 
321 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
550 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  34.01 
 
 
505 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  35.67 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  30.36 
 
 
497 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  31.82 
 
 
544 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  32.69 
 
 
532 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.14 
 
 
502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  34.56 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  30.82 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  31.82 
 
 
544 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  29.39 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  35.45 
 
 
511 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  28.29 
 
 
506 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  31.39 
 
 
309 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  31.39 
 
 
309 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>