57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0079 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  736    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  26.67 
 
 
385 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  25.37 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  26.09 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  28.53 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  25.81 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  23.45 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  25.38 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  24.01 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  28.06 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  24.22 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  23.08 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  26.61 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  25.09 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  26.29 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  27.09 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  23.61 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  24.17 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  26.32 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  21.04 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  25.7 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  23.72 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  26.32 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  23.91 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  23.22 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  23.47 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  25.73 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  25.73 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  21.75 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  23.61 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  23.68 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  25.21 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  26.23 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  28.23 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  25.99 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  21.86 
 
 
368 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  24.84 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  26.51 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  23.63 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  22.67 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  24.29 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  23.13 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  26.5 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  25.37 
 
 
359 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  21.77 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  23.7 
 
 
363 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  18.36 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  22.65 
 
 
355 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  25.35 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  24.32 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  22.9 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1708  GerZB  23.19 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000089692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  23.35 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  25.25 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  20.94 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  21.54 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  24.82 
 
 
366 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>