30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0054 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0054  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  322  9e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000282525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2110  protein of unknown function DUF458  54.14 
 
 
157 aa  184  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0078  hypothetical protein  52.87 
 
 
156 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0046  hypothetical protein  50.96 
 
 
157 aa  177  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0053  hypothetical protein  49.68 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0047  protein of unknown function DUF458  50.63 
 
 
158 aa  167  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21710  hypothetical protein  48.43 
 
 
159 aa  160  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.761534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2225  hypothetical protein  45.58 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000107696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0166  protein of unknown function DUF458  43.4 
 
 
170 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1944  hypothetical protein  41.07 
 
 
182 aa  124  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0112  protein of unknown function DUF458  40.13 
 
 
165 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.38538  hitchhiker  0.00353815 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0164  hypothetical protein  37.01 
 
 
156 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4034  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4000  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3743  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3727  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4105  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2687  hypothetical protein  36.14 
 
 
172 aa  97.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3895  hypothetical protein  34.94 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4198  hypothetical protein  34.94 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4088  hypothetical protein  34.94 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1152  hypothetical protein  34.94 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3812  hypothetical protein  35.54 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1245  hypothetical protein  34.42 
 
 
147 aa  92  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1210  hypothetical protein  34.42 
 
 
147 aa  92  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3603  protein of unknown function DUF458  31.48 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000214172  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1348  protein of unknown function DUF458  31.91 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.187185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0575  protein of unknown function DUF458  27.42 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7091  protein of unknown function DUF458  29.84 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00936818  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1009  protein of unknown function DUF458  25.33 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.889316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>