More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0053 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  47.81 
 
 		 288 aa  232  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  42.91 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  43.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  43.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  43.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  43.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  43.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  43.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  43.42 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  41.84 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  42.18 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  41.84 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  43.53 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  40.82 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  40.85 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  40.73 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.79 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  38.97 
 
 		 271 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  38.79 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  38.36 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  40.88 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  39.64 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  36 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  37.76 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  41.6 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  36.13 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  36.1 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  36.94 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  36.06 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  35.09 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  38.55 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  36.06 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  41 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  34.69 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  35.36 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  35.47 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  34.33 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  35.84 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  37.27 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  35.56 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  37.14 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  35.45 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  36.82 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 		 266 aa  162  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  37 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.23 
 
 		 264 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  34.4 
 
 		 281 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  38.4 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  34.7 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  35.5 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  34.33 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  34.14 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  33.94 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  34.3 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>