20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0041 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0041  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  291  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.255674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  29.33 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  26.72 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4202  protein of unknown function DUF327  30.22 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00741832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2250  protein of unknown function DUF327  25.17 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.722735  hitchhiker  0.00505193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0035  protein of unknown function DUF327  32.14 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0055  hypothetical protein  29.69 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.449218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  27.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  25.44 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0514  protein of unknown function DUF327  29.01 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3232  protein of unknown function DUF327  25.83 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0450  hypothetical protein  25.24 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15530  hypothetical protein  27.97 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3035  protein of unknown function DUF327  28.89 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0708  hypothetical protein  24.6 
 
 
148 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0659  protein of unknown function DUF327  24.66 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3709700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1683  hypothetical protein  26.83 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0646  hypothetical protein  26.8 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000332028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  21.9 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1375  hypothetical protein  24.56 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00361251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>