25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0035 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0035  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  461  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2126  putative ATP/GTP-binding protein  54.63 
 
 
216 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.542682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0046  hypothetical protein  52.73 
 
 
230 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0020  hypothetical protein  53 
 
 
218 aa  231  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.921254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2076  hypothetical protein  48.46 
 
 
237 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0032  hypothetical protein  45.57 
 
 
158 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000810858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1068  hypothetical protein  29.36 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1044  hypothetical protein  28.44 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0869  hypothetical protein  31.05 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1679  hypothetical protein  28.7 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00685149  normal  0.0163026 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1402  hypothetical protein  30.5 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1473  hypothetical protein  28.57 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0106  hypothetical protein  30.23 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0440784  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0589  putative ATP/GTP-binding protein  31.16 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0940  hypothetical protein  29.51 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0109  hypothetical protein  28.77 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1610  hypothetical protein  28.11 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0551  hypothetical protein  27.45 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1387  putative ATP/GTP-binding protein  30.65 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1707  hypothetical protein  25.64 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06710  hypothetical protein  27.14 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17570  hypothetical protein  29.48 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0881  hypothetical protein  25.13 
 
 
228 aa  55.8  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1094  hypothetical protein  27.65 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07920  hypothetical protein  23.53 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00573747  normal  0.450178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>