90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0012 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  776    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  51.41 
 
 
395 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  47.89 
 
 
373 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  46.46 
 
 
379 aa  332  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  44.24 
 
 
1101 aa  315  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  44.44 
 
 
387 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  43.73 
 
 
365 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  44.7 
 
 
387 aa  302  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  42.82 
 
 
377 aa  289  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  41.51 
 
 
395 aa  284  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  41.53 
 
 
381 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  38.14 
 
 
1852 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  29.44 
 
 
417 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  30.29 
 
 
400 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  28.8 
 
 
408 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  29.29 
 
 
401 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  27.9 
 
 
383 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  29.17 
 
 
389 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  27.67 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  27.82 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  27.95 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.51 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.94 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  26.1 
 
 
402 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.22 
 
 
387 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.77 
 
 
932 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.15 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  24.7 
 
 
933 aa  93.2  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.84 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  24.77 
 
 
629 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.66 
 
 
931 aa  86.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  25.57 
 
 
934 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  26.29 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  24.87 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  21.58 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.83 
 
 
951 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  25.39 
 
 
401 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  24.93 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  26.57 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  23.64 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  26.05 
 
 
399 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  23.14 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  24.93 
 
 
392 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  25.29 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  25.29 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  25.29 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  25.29 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  25.29 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  25.14 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  25.86 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  28.25 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  27.32 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  25.1 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  30 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  23.78 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  25.63 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  23.38 
 
 
828 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  23.62 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  28.32 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  26.77 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  25.91 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  21.98 
 
 
427 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  27.37 
 
 
397 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  25.73 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  25.48 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  25.48 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  27.32 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  26.32 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  27.32 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  25.56 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  24.7 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  26.15 
 
 
400 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  24.22 
 
 
386 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  22.48 
 
 
828 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  25.33 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  23.33 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  24.07 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  22.77 
 
 
460 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  21.58 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  23.29 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  22.56 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  28.72 
 
 
385 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  24.12 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  22.06 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  25.42 
 
 
406 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  23.06 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  24.53 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  24.53 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  24.73 
 
 
377 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  22.77 
 
 
398 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>