134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5348 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  354  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  45.69 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  38.26 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  35.29 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  38.31 
 
 		 169 aa  95.1  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  40.29 
 
 		 163 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  36.22 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  39.29 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  39.55 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  34.41 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  39.71 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  39.71 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  35.82 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  37.86 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  34.95 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  35.82 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  33.97 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  36.03 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  33.58 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  36.03 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  33.51 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  30.65 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  31.25 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  35.38 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0076  hypothetical protein  43.23 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.580617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  31.03 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  32.84 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  33.58 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  37.14 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  35.77 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  33.58 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  32.84 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  31.4 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  33.1 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  33.57 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  37.27 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  35.51 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  36.43 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  35.48 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  36.17 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  35.04 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  35.29 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  30.22 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  30.57 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  32.73 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  28.68 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  31.45 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  28.26 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  32.89 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  33.57 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  33.58 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  29.3 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  29.68 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3316  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.080599  normal  0.507999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  27.27 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  34.59 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  36.81 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  36.64 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  42.47 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  27.68 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  33.55 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  25.27 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  26.34 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  26.34 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  29.1 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  25.93 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  27.81 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  25.93 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  33.08 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5210  hypothetical protein  24.59 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000680106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  33.08 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  33.08 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  33.08 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  33.08 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  33.08 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  33.08 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  30.5 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3670  hypothetical protein  29.95 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  30.15 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  36.36 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  29.85 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  25.81 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  30.15 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  35.71 
 
 		 236 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  31.01 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  35.71 
 
 		 236 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  33.06 
 
 		 190 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6141  hypothetical protein  25.53 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  29.58 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3728  hypothetical protein  29.58 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657091  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  32.88 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>