More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5274 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5274  protease Do  100 
 
 		 501 aa  986    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  63.33 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  56.35 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  51.87 
 
 		 497 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  44.47 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.56 
 
 		 491 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.22 
 
 		 508 aa  342  9e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  41.11 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  41.11 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  44.21 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.38 
 
 		 506 aa  336  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.28 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.22 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.22 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.09 
 
 		 501 aa  333  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  39.89 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.24 
 
 		 506 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.42 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.42 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.03 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.98 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  39.73 
 
 		 520 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  42 
 
 		 524 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.7 
 
 		 523 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  40.73 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  41.8 
 
 		 508 aa  320  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.71 
 
 		 471 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  40.33 
 
 		 501 aa  319  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  41.22 
 
 		 496 aa  318  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  40.48 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.01 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  40.38 
 
 		 529 aa  316  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  41.05 
 
 		 496 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  39.47 
 
 		 503 aa  316  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  40.4 
 
 		 517 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  40.37 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  39.47 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  39.92 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  40.82 
 
 		 491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  41.05 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  39.92 
 
 		 524 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  41.97 
 
 		 499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.67 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  41.21 
 
 		 497 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  38.7 
 
 		 523 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.19 
 
 		 501 aa  312  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  39.77 
 
 		 527 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.42 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  39.73 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  42.86 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.24 
 
 		 497 aa  310  5e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  40.08 
 
 		 516 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.04 
 
 		 524 aa  309  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  38.45 
 
 		 520 aa  309  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.04 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.17 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.48 
 
 		 528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.58 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.83 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.21 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41.3 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.2 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  38.39 
 
 		 527 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  38.49 
 
 		 498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  40.09 
 
 		 498 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.65 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  38.09 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41 
 
 		 476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  37.62 
 
 		 527 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  40.83 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  41.11 
 
 		 511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.96 
 
 		 481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  40.39 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  40.39 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  40.12 
 
 		 501 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  40.39 
 
 		 498 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.93 
 
 		 472 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  40.38 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  41.54 
 
 		 516 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  38.69 
 
 		 537 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.65 
 
 		 457 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.66 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.66 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.66 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.07 
 
 		 475 aa  299  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.24 
 
 		 482 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  41.04 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.74 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  40.34 
 
 		 489 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.3 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  40.69 
 
 		 497 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  38.24 
 
 		 526 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.92 
 
 		 485 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  41.72 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.72 
 
 		 588 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.41 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.38 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  40.38 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  39.11 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.38 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>