79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5264 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1268    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  52.67 
 
 		 617 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  49.13 
 
 		 631 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  26.62 
 
 		 827 aa  190  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  26.45 
 
 		 634 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  26.62 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  26.32 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  25.6 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  25.2 
 
 		 588 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  25.92 
 
 		 612 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  25.29 
 
 		 613 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0350  DNA helicase II related protein, putative  23.02 
 
 		 394 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00193946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  24.36 
 
 		 616 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  28.05 
 
 		 619 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  22.57 
 
 		 616 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.46 
 
 		 607 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  30.45 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  30.43 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  25.42 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  25.36 
 
 		 601 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  25.77 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  28.44 
 
 		 610 aa  71.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  29.08 
 
 		 579 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  26.29 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  26.6 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  38.2 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  30.27 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  26.21 
 
 		 607 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0349  DNA helicase II related protein, putative  24.69 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.217591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  24.94 
 
 		 551 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  23.92 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  26.25 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  30.13 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  30.13 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  26.47 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  29.21 
 
 		 626 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  31.85 
 
 		 555 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  25.42 
 
 		 554 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  31.85 
 
 		 555 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  29.87 
 
 		 669 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  25.42 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  25.42 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  25.42 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  25.42 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  25.42 
 
 		 554 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  26.6 
 
 		 573 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  28.43 
 
 		 719 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  26.75 
 
 		 544 aa  51.2  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  27.56 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  30 
 
 		 555 aa  50.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  29.95 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  32.9 
 
 		 551 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  28.49 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  27.11 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  26.42 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  26.42 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  27.95 
 
 		 541 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  26.92 
 
 		 388 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  26.63 
 
 		 324 aa  47.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  27.51 
 
 		 720 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  24.41 
 
 		 606 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 778 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  23.79 
 
 		 564 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  25.71 
 
 		 778 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  25.71 
 
 		 776 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  24.54 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  25.71 
 
 		 776 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  25.71 
 
 		 776 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  25.71 
 
 		 777 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  25.71 
 
 		 776 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.21 
 
 		 1125 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  33.91 
 
 		 753 aa  45.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  25.71 
 
 		 777 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  25.71 
 
 		 777 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  26.54 
 
 		 711 aa  44.3  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.97 
 
 		 1234 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.97 
 
 		 1234 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  27.15 
 
 		 752 aa  43.9  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>